Informationen zur Anzeige:
Data Steward / Bioinformatiker oder Bioinformatikerin (m/w/d)
Garching bei München
Aktualität: 26.07.2024
Anzeigeninhalt:
26.07.2024, Technische Universität München (TUM)
Garching bei München
Data Steward / Bioinformatiker oder Bioinformatikerin (m/w/d)
Aufgaben:
Als Bioinformatiker oder Bioinformatikerin spielen Sie eine entscheidende Rolle bei der Entwicklung, Evaluierung und Umsetzung von Next Generation Sequencing (NGS)-Workflows innerhalb von GHGA. Sie arbeiten in einer Hochdurchsatzumgebung und nutzen die mit dem Leibniz Rechenzentrum (LRZ) in Zusammenarbeit entwickelte OpenStack-Plattform, um die GHGA Cloud-Infrastruktur zu verbessern und abzusichern. Darüber hinaus sind Sie Mitglied im nationalen GHGA-Konsortium, wo Sie moderne Methoden und NGS-Workflows entwickeln, verbessern und anwenden. Sie stellen auch sicher, dass die Anwendung der Workflows über die Data Hubs hinweg harmonisiert wird. Als Mitglied des MDSI organisieren Sie Hackathons und Workshops und unterstützen vielfältige Forschungsdatenmanagement-Aktivitäten und -Cluster an der TUM. Durch Ihr Fachwissen und Ihre aktive Einbindung in die lokale Forschungsgemeinschaft tragen Sie zur strategischen Entwicklung zukünftiger Dienstleistungen an der Universität bei, wo Sie Unterstützung und Beratung bei Projekten leisten werden, die Fachwissen im Bereich Forschungsdatenmanagement erfordern. Insgesamt werden mehr als 50% Ihrer Arbeitszeit in der Forschung verbracht.
Qualifikationen:
Fundierte Kenntnisse in der Entwicklung und Anwendung von NGS/Omics-Workflows (z.B. NextFlow, snakemake, WDL)
Erfahrungen im Benchmarking von NGS-Workflows
Sicherer Umgang mit der OpenStack-Plattform zur Anpassung und Bereitstellung des GHGA-Software-Stacks
Vertrautheit mit Methoden und Tools der Bioinformatik und des Forschungsdatenmanagements
Kenntnisse in der Verwaltung von Linux-Systemen und Containern
Ausgezeichnete organisatorische Fähigkeiten zur Koordination von Workshops, Hackathons und Seminaren
Effektive Kommunikations- (auf Englisch) und zwischenmenschliche Fähigkeiten zur Interaktion mit der lokalen Forschungs-gemeinschaft und für Beiträge zum strategischen Planungsprozess, zum Verfassen von Texten und zu Beratungsaufgaben
Masterabschluss oder höher in der Bioinformatik, Informatik oder verwandten Fachrichtungen
Berufsfeld
Bundesland
Standorte