Bioinformatikerin / Bioinformatiker - Klinik für Infektiologie
27.05.2025
Universitätsklinikum Frankfurt
Frankfurt am Main
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Bioinformatikerin / Bioinformatiker - Klinik für Infektiologie
Frankfurt am Main
Aktualität: 27.05.2025
Anzeigeninhalt:
27.05.2025, Universitätsklinikum Frankfurt
Frankfurt am Main
Bioinformatikerin / Bioinformatiker - Klinik für Infektiologie
Aufgaben:
Durchführung von Mikrobiomanalysen und Integration von zusätzlichen OMICS-Daten und klinischen Daten
Ergänzende metagenomische Analyse von Proben aus bestehenden Biobanken und Sammlungen
Durchführung von statistischen und bioinformatischen Analysen von komplexen Datensätzen im medizinischen Kontext
Entwicklung von neuen bioinformatischen Werkzeugen und Auswertungsstrategien
Nutzung vorhandener bioinformatischer Werkzeuge und Lösungen, u.a. zur Vorhersage der Nährstoffkonkurrenz zwischen Mikroorganismen und anderer Mechanismen der Kolonisationsresistenz
Entwicklung neuer Bewertungsanalysestrategien, Werkzeuge und Vorhersagemodelle
Validierung und Benchmarking dieser Instrumente und Modelle anhand verschiedener Datensätze
Unterstützung der Arbeitsgruppe
Unterstützung bei der Einwerbung von Drittmitteln und Vorbereitung von Förderanträgen für klinische Studien
Qualifikationen:
Erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium (M. Sc.) der Bioinformatik, Biologie. Chemie oder eines vergleichbaren Bereichs
Abgeschlossene oder eingereichte Promotion zum Zeitpunkt des Eintritts, idealerweise mit einem thematischen Schwerpunkt in den Gesundheitswissenschaften
Erfahrung mit der Analyse von Sequenzdaten (z. B. mit Tools wie Qiime 2, MethaPhlAn, Kraken oder HUMAnN)
Verständnis für mikrobiologische und/oder molekularbiologische Grundlagen
Interesse am menschlichen Mikrobiom und an klinischer Forschung
Erfahrung im Projekt- und Datenmanagement ist von Vorteil
Solide Kenntnisse von Programmiersprachen wie Python, R und Bash; Erfahrung mit Hochleistungsrechnern (HPC) ist von Vorteil
Sicherer Umgang mit MS Office
Flexibilität, Teamfähigkeit, Verantwortungsbewusstsein, Lernbereitschaft
Aufgrund gesetzlicher Bestimmungen ist ein gültiger Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung notwendig
Berufsfeld
Öffentlicher Dienst, Verwaltung
Forschung, Lehre
Forschung & Entwicklung
Informationstechnologie, TK
IT/TK Softwareentwicklung
Pharma, Chemie, Med., Biotechn.
Biologische, Klinische F&E
Labor
Bundesland
Standorte